玉米液化残渣全利用制备高活力柠檬酸黑曲霉种子的方法，属于废弃物资源化及发酵技术领域。玉米粉经喷射液化、固液分离后得到玉米液化残渣；电子束辐射处理玉米残渣，获得辐射残渣；辐射残渣与水按一定比例混合，置于超声波环境中充分浸泡，依次添加纤维素酶与蛋白酶进行水解；在上述酶解液中添加复合糖化酶(包括葡萄糖淀粉酶和普鲁兰酶)，获得液化残渣水解液；液化残渣水解液配置种子培养基，培养柠檬酸黑曲霉种子。本发明实现了玉米液化残渣全利用，获得了高活力的柠檬酸黑曲霉种子，提高了经济效益，具有良好的应用前景。

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