本发明公开了一种靶向VEGF与mucin1的抗肿瘤疫苗、编码基因、表达载体、表达工程菌及应用，属于生物技术领域。抗肿瘤疫苗融合蛋白以VEGF165、VEGF165b或其相应改构的VEGF突变体为表位载体，通过在载体的N端或C端连接至少一段肿瘤相关抗原mucin1的表位肽段，构成具有双靶向作用的抗肿瘤疫苗。该疫苗中VEGF既能作为表位载体增强与之连接的mucin1表位的抗原性，杀伤过表达mucin1的肿瘤细胞，其自身又能作为抗原，产生针对VEGF的抗体，抑制肿瘤血管生成，切断肿瘤的营养供给。同时，表位载体具有肝素结合域，可以与肝素琼脂糖凝胶结合，有利于后续的蛋白纯化操作。

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