本发明公开了经过遗传改造的紫色杆菌素生物合成基因簇、重组表达载体、工程菌及其应用，通过对紫色杆菌素生物合成基因簇的核糖体结合位点进行定点突变和密码子缺失突变改造，促进紫色杆菌素合成蛋白的有效翻译，获得生产潜力显著提高的改造基因簇；通过将上述改造基因簇或者含有改造基因簇的重组载体导入到宿主菌，获得了高产紫色杆菌素的工程菌；进一步对工程菌的发酵条件进行了优化并提供紫色杆菌素的分离纯化方法。本发明构建的基因工程菌株不仅能够显著提高紫色杆菌素的产量，且与常规的紫色杆菌素20℃或25℃低温发酵不同，在25‑37℃的温度条件下均可高效生产紫色杆菌素代谢产物，解决了发酵过程中的降温成本高的问题，适用于规模化生产。

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